Innen gleicht die renovierte "Ex-Batteria" einem Kirchenschiff mit zwanzig Seitenaltären, Kabinetten, in denen Reinhold Messner Phase für Phase die Erschließungsgeschichte der Dolomiten erzählt. Er erzählt sie anhand von Reliquien, Erinnerungsstücken an jene Forscher und Kletterer, die mit ihren Entdeckungen, neuen Wegen und Erstbegehungen alpine Geschichte geschrieben haben. Sie führt von Dolomieu und den englischen Pionieren zu Michl Innerhofer und Georg Winkler, von Angelo Dibona und Michele Bettega zu Emilio Comici und dem Sechsten Grad. Und über die Kletterer der "Direttissima" wie Lothar Brandler zu "Moderne Zeiten" und Alexander Huber.

Das Herzstück des Museums ist die Kunst im Hauptschiff, die sogenannte große Galerie. Gemälde mit Dolomitenansichten von der Romantik bis heute, von Thomas Ender und dem Erzherzog Rainer von Österreich über E.T. Compton bis zu Hamish Fulton und Stephan Huber. Zwischen den Gemälden öffnen sich Fenster mit dem spektakulärsten Blick auf die Gipfel draussen.

Das Museum in den Wolken hat noch mehr zu bieten: 250 Millionen Jahre alte Claraia-Muscheln, 240 Millionen Jahre alte Palmfarne und weitere Fossilien erinnern daran, dass die Dolomiten einst Korallenstöcke in einem tropischen Meer gewesen sind.